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Text File  |  1995-03-04  |  1.2 KB  |  30 lines
  1. ***********************************
  2. * Ribosomal protein S14 signature *
  3. ***********************************
  4.  
  5. Ribosomal protein S14 is one of the proteins from the small ribosomal subunit.
  6. In Escherichia  coli,  S14  is  known  to  be required for the assembly of 30S
  7. particles and may also be  responsible for determining the conformation of 16S
  8. rRNA at the A site. It belongs to a family of ribosomal proteins which, on the
  9. basis of sequence similarities [1,2], groups:
  10.  
  11.  - Eubacterial S14.
  12.  - Archaebacterial Methanococcus vannielii S14.
  13.  - Algal and plants chloroplast S14.
  14.  - Plant mitochondrial S14.
  15.  - Yeast mitochondrial MRP2.
  16.  - Mammalian S29.
  17.  
  18. S14 is  a  protein  of 53 to 115 amino-acid residues. Our signature pattern is
  19. based on the few conserved positions located in the center of these proteins.
  20.  
  21. -Consensus pattern: R-x(0,1)-C-x(11,12)-[LIVMF]-x-[LIVMF]-[SC]-[RG]-x(3)-[RN]
  22. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  23. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: 4.
  24. -Last update: June 1994 / Text revised.
  25.  
  26. [ 1] Chan Y.-L., Suzuki K., Olvera J., Wool I.G.
  27.      Nucleic Acids Res. 21:649-655(1993).
  28. [ 2] Otaka E., Hashimoto T., Mizuta K.
  29.      Protein Seq. Data Anal. 5:285-300(1993).
  30.